Шесть разделов постоянной экспозиции — от Зала Корана и доисламского Согда до Нового Узбекистана и научной библиотеки Центра.
Зал Корана – духовное сердце и архитектурное ядро музея истории исламской цивилизации, выстроенное вокруг Мусхафа Усмана – одной из древнейших сохранившихся рукописей Корана. Этот священный текст представляет собой рукопись VII века, написанную на выделанной оленьей коже и включённую в реестр ЮНЕСКО «Память мира».
Зал Корана расположен в центре комплекса. Именно здесь с особым почтением хранится Мусхаф Усмана. Эта уникальная рукопись состоит из 338 страниц, на каждой из которых крупным куфическим письмом выведено по 12 строк текста. Для каждого листа использовалась тщательно выделанная кожа, хорошо сохранившаяся до наших дней.
Помимо основной рукописи, в зале представлена коллекция «114 рукописей Корана». Они были созданы в разные периоды правления Саманидов, Караханидов, Тимуридов, Шейбанидов и Золотой Орды.
Художественное решение зала отличается особой выразительностью. Здесь аяты из Корана Усмана воспроизведены на восьми шёлковых коврах ручной работы. Их мягкое сияние и тончайшая отделка создают атмосферу покоя, размышления и духовного величия, позволяя каждому посетителю ощутить связь времён и словно приблизиться к самому сердцу исламской цивилизации.